반응형 global alignment1 Bioinformatics | DNA Sequence Alignment (Global Alignment) DNA 서열 Alignment 에는 Global과 Local Alignment가 있다. Global Alignment 는 유전자 서열 전체 길이와 함께 두 서열을 비교하고 정렬하여 최대로 정렬된 뉴클레오타이드 또는 아미노산을 보여주기 위한 정렬이다. 두 개의 서열이 있을 때 시작점부터 정렬하여 서열 끝까지 비교하며 가장 유사한 특성의 sequence를 뽑아내는 것이다. Two Sequence 가 아래와 같다고 했을 때, - AGTGATG & GTTAG Scoring을 하고 backtracking하며 alignment를 뽑아내면 된다. Scoring할 때 +, - 점수는 임의로 정해서 진행하면 된다. 필자는 두 서열의 유전자가 같을 때는 +2점 다를 때는 -1점을 부여했다. Scoring Matrix # .. 2021. 6. 22. 이전 1 다음 반응형